Jak dla mnie problem leży w niewłaściwym powiązaniu (lub braku powiązania) sygnalizatora 1Je z blokadą 1Je. Co mam na myśli - na szlakach gdzie wszystko działa poprawnie (czy na Okoniu, czy na innych sceneriach) nastawiając przebieg wystarczy kliknąć na symbol blokady liniowej i przebieg się nastawi, natomiast w przypadku szlaku Je to nie działa i trzeba do przebiegu wskazywać właśnie na symbol sygnalizatora 1Je. Wydaje mi się, jest to w jakiś sposób związane z możliwością wyprawiania bez blokady.
Ps. Drobna wskazówka - z ciekawości zerknąłem do edytora scs i zauważyłem, że przy blokadzie 1Je jest ustawiony PBL punkt końcowy przebiegu wyjściowego jako "Ok_1Je!". Czy przypadkiem to nie powinno być "Ok_1Je", bez tego wykrzyknika? Jak coś to tylko moja luźna wskazówka, nie mam doświadczenia w tych sprawach i możliwe że to zupełnie nie ma związku z problemem.