Od czasu wydania najnowszej wersji mam notoryczne problemy z wagonami.
1. Niektóre z typów wagonów są "wagonami duchami". Przy próbie podłączenia się do nich, lokomotywa nie koliduje z nimi (przenika), przez co brak jest możliwości podłączenia ich. Przykładem takiego wagonu w grze jest "158a_PKPIC_A9mnopuz_01", ale jest ich o wiele więcej.
2. Gdy gracz rozłącza się od składu w celu pozostawienia wagonów na stacji, mimo opuszczenia odcinka izolowanego, po wyjściu gracza wagony znikają.
Błędy te są dość uciążliwe, gdyż mocno utrudniają, a czasami uniemożliwiają manewry.