Bukowno to stacja węzłowa, na której od linii kolejowej z Tunelu odgałęzia się dwutorowa linia kolejowa nr 156, służąca jako połączenie z dużą stacją w Jaworznie Szczakowej. Bukowno pełni również rolę stacji wjazdowej w rejon Górnego Śląska. Posiada aż 10 torów głównych, z których cztery znajdują się przy peronach. Dla obsługi podróżnych służy obecnie jeden, dwukrawędziowy peron wyspowy - drugi pozostaje natomiast niewykorzystywany. Perony połączone są z budynkiem dworca poprzez przejście podziemne. Na wysokości stacji normalnotorowej przebiega także szerokotorowa linia LHS, na której urządzona jest mijanka - ostatnia posterunek na linii przed stacją końcową w Sławkowie. Od stacji normalnotorowej odchodzi kilka bocznic, prowadzących m.in. zakłady Boltech, których tor dojazdowy przecina w jednym poziomie tor LHS. Na stacji mieści się także bocznica dawnej sekcji eksploatacji. Ruch pociągów prowadzony jest przez nastawnię "Bo", która posiada urządzenia przekaźnikowe z sygnalizacją świetlną i obsługuje zarówno tory normalne, jak i szerokie. Z nastawnią tą współpracuje posterunek SKP od strony Olkusza oraz strażnica od strony Sławkowa, która pełni również funkcje SKP dla linii nr 65.